大小蠹来源地的COⅠ基因标记
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江苏出入境检验检疫局基金课题(2008KJ37); 科技部质检公益性行业科研专项(201110038); 国家科技支撑计划课题(2012BAK11B03)


Investigating the provenance of Dendroctonus using COⅠ gene
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    摘要:

    【背景】大小蠹属昆虫是重要的林木害虫,我国口岸有多次截获记录,确定大小蠹的来源地可以有针对性地加强对大小蠹的检验检疫工作。【方法】测定了5种高风险大小蠹(红脂大小蠹、红翅大小蠹、中欧山松大小蠹、落叶松大小蠹和间大小蠹)共12个样本的线粒体DNA细胞色素氧化酶C亚基Ⅰ基因(COⅠ)的部分序列。【结果】利用巢式PCR技术,在不同种类的大小蠹样本中均获得了530 bp的靶标片段,比对分析显示,不同种大小蠹之间的COⅠ序列差异显著,同种大小蠹不同个体之间的COⅠ序列存在一定的差异,但差异不显著。系统进化树分析结果显示,大小蠹可以明显分为2支,其中,间大小蠹单独为一分支,另一分支由红脂大小蠹、红翅大小蠹、中欧山松大小蠹和落叶松大小蠹组成;同时,同种大小蠹不同个体的来源情况在进化树中有一定体现。【结论与意义】COⅠ基因可以较好地反映样本的来源地,对今后制定大小蠹的具体检验检疫措施有实际指导意义。

    Abstract:

    【Background】Dendroctonus spp., the noxious forest pests, have been repeatedly intercepted in many ports in China. For custom officers, the main challenge remains to determine the provenance of these insects. 【Method】Using nested PCR, the cytochrome C oxidase subunit I gene (COⅠ) in mtDNA was examined for 12 samples from Dendroctonus valens, D.rufipennis, D.ponderosae, D.simplex and D.adjunctus. 【Result】The nested PCR showed variation between and within groups for a 530 portion of COⅠ. Molecular phylogenetic analysis based on COⅠ gene showed that Dendroctonus spp. could be divided into two clades. Clade 1 included D.adjunctus, and Clade 2, D.valens, D.rufipennis, D.ponderosae and D.simplex. The provenance of the specimens analyzed in this study can be identified within the evolutionary tree. 【Conclusion and significance】The results suggest that COⅠ may help determine the provenance of specimens intercepted in ports thus providing more adequate information to custom officers.

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引用本文

殷玉生,张帆,钱路,郑斯竹,安榆林.大小蠹来源地的COⅠ基因标记[J].生物安全学报中文版,2012,21(3):201-209

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《生物安全学报》
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